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T1 : Génomique et transcriptomique : analyse in silico

Description

Objectif : identifier les précurseurs des neuropeptides et des RCPG à partir des bases de données transcriptomiques et génomiques disponibles. Les précurseurs de neuropeptides (huître et seiche) et RCPG (huître) étant déjà identifiés par le Partenaire 1, l'accent est mis sur l'identification des récepteurs de seiche et l'identification des précurseurs de neuropeptides et de RCPG chez l’anguille et le corail E. ancora.

Démarche expérimentale : l’analyse in silico des transcriptomes et/ou génomes est réalisée en utilisant des logiciels de bioinformatique. L’analyse de BLAST permet d’identifier et d'annoter les RCPG. L’identification des précurseurs de neuropeptides est facilitée en utilisant un logiciel à façon développé à l’Université de Caen Basse-Normandie, "Peptraq".